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La taxinomie du genre Pinus se base sur des caractéristiques morphologiques et anatomiques variées telles que le nombre d'aiguilles par fascicule ou encore les caractéristiques des cônes et des graines, ainsi que sur des analyses ADN. De très nombreuses classifications ont été proposées depuis Linné et elles sont encore en cours de discussion actuellement. Par conséquent la classification présentée ici est indicative et susceptible de changer. Cependant, un certain nombre de regroupements sont généralement reconnus.